Общее руководство федеральной системой ОМС осуществляет Федеральный фонд ОМС. Он же аккумулирует федеральную составляющую страховых взносов на ОМС, отчисляемых старахователями (работодателями).
В отдельных субъектах Российской федерации функции сбора средств, контроля за медицинскими страховщиками формирования локальных условий функционирования системы ОМС осуществляют Территориальные фонды ОМС.
